Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-3Q3SY46 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms