Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms