Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDRF1Q3B7T1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms