Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms