Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC27Q2M243 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms