Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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