Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRNQ16849 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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