Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NRF1Q16656 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms