Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms