Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FXNQ16595 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FXNQ16595 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FXNQ16595 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FXNQ16595 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FXNQ16595 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FXNQ16595 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FXNQ16595 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FXNQ16595 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FXNQ16595 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FXNQ16595 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FXNQ16595 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FXNQ16595 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FXNQ16595 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FXNQ16595 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FXNQ16595 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FXNQ16595 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FXNQ16595 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FXNQ16595 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FXNQ16595 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FXNQ16595 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FXNQ16595 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FXNQ16595 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FXNQ16595 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FXNQ16595 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FXNQ16595 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FXNQ16595 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FXNQ16595 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FXNQ16595 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FXNQ16595 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FXNQ16595 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FXNQ16595 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FXNQ16595 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FXNQ16595 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms