Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP35Q16560 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP35Q16560 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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