Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2F4Q16254 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms