Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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