Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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