Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATP6AP1Q15904 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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