Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms