Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD3Q15059 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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