Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC3Q15034 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC3Q15034 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC3Q15034 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC3Q15034 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC3Q15034 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC3Q15034 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC3Q15034 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC3Q15034 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC3Q15034 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC3Q15034 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC3Q15034 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC3Q15034 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC3Q15034 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC3Q15034 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC3Q15034 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC3Q15034 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC3Q15034 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC3Q15034 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC3Q15034 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HERC3Q15034 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC3Q15034 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC3Q15034 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC3Q15034 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC3Q15034 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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