Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA4Q14CN2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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