Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSPNQ14714 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSPNQ14714 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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