Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms