Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDC1Q14676 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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