Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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