Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL4Q14135 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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