Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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