Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNGB1Q14028 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
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