Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDK13Q14004 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
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