Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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ITGA9Q13797 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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ITGA9Q13797 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA9Q13797 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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ITGA9Q13797 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA9Q13797 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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ITGA9Q13797 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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ITGA9Q13797 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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ITGA9Q13797 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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ITGA9Q13797 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA9Q13797 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA9Q13797 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA9Q13797 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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ITGA9Q13797 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA9Q13797 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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ITGA9Q13797 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA9Q13797 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA9Q13797 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA9Q13797 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA9Q13797 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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ITGA9Q13797 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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ITGA9Q13797 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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ITGA9Q13797 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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ITGA9Q13797 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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ITGA9Q13797 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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