Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB3Q13751 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms