Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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