Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTCH1Q13635 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
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