Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
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