Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NAE1Q13564 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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NAE1Q13564 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NAE1Q13564 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NAE1Q13564 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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NAE1Q13564 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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NAE1Q13564 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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