Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCIRG1Q13488 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
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