Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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