Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.436e-9■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.356e-9■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 WASHC4-204ENST00000547404 719 ntTSL 515.5■□□□□ 0.076e-9■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 WASHC4-201ENST00000311317 2897 ntTSL 215.36■□□□□ 0.056e-9■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 TYMS-204ENST00000579128 925 ntTSL 212.81□□□□□ -0.366e-9■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 MMS22L-209ENST00000509383 3083 ntTSL 1 (best)9.31□□□□□ -0.926e-9■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 WASHC4-208ENST00000550053 5819 ntTSL 56.99□□□□□ -1.296e-9■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.396e-9■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 MMS22L-210ENST00000510018 966 ntTSL 56.29□□□□□ -1.46e-9■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.466e-9■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.896e-9■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.96e-9■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.89e-7■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 FBXW7-212ENST00000604872 970 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.899e-7■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.989e-7■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 WIPF2-201ENST00000323571 7474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 319.64■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 IPO11-214ENST00000514647 584 ntTSL 27.32□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 IPO11-208ENST00000506200 554 ntTSL 46.58□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 ACSL3-209ENST00000535678 560 ntTSL 320.34■□□□□ 0.851e-11■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-11■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 ACSL3-204ENST00000413316 650 ntTSL 49.64□□□□□ -0.871e-11■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 DCAF6-208ENST00000470721 2803 ntTSL 216.23■□□□□ 0.194e-8■■■■■ 28.3
TARDBPQ13148 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.763e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 PPP2R5E-203ENST00000553266 1690 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.533e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CLPTM1L-207ENST00000506641 792 ntTSL 516.5■□□□□ 0.233e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CHD1-202ENST00000414220 434 ntTSL 514.51□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 SLC25A25-202ENST00000373066 3714 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.663e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 SLC25A25-201ENST00000373064 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CLPTM1L-208ENST00000507195 628 ntTSL 510.78□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 GSK3B-202ENST00000316626 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.843e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CHD1-205ENST00000508756 724 ntTSL 59.31□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 PPP2R5E-206ENST00000556484 1465 ntTSL 28.61□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.083e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CHD1-206ENST00000511067 817 ntTSL 57.06□□□□□ -1.283e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 SLC25A25-208ENST00000472769 676 ntTSL 36.92□□□□□ -1.33e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 WNK1-211ENST00000540360 668 ntTSL 26.32□□□□□ -1.43e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 PPP2R5E-205ENST00000556150 744 ntTSL 35.49□□□□□ -1.533e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.543e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CHD1-211ENST00000514344 2955 ntTSL 53.59□□□□□ -1.843e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.943e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CLASP2-209ENST00000468888 6978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.297e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.377e-8■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.511e-10■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.531e-10■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 SLC6A6-207ENST00000618278 6401 ntTSL 510.82□□□□□ -0.681e-10■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 KLC1-218ENST00000555467 559 ntTSL 224.73■■□□□ 1.555e-7■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 KLC1-223ENST00000557172 540 ntTSL 49.25□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.996e-9■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 WDR37-202ENST00000358220 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.763e-7■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 ADAM17-201ENST00000310823 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-10■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.264e-7■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 ZNF670-201ENST00000366503 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 ZNF670-ZNF695-201ENST00000465049 1042 ntAPPRIS P5 TSL 510.85□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 28.2
TARDBPQ13148 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.45e-16■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.255e-16■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 LCORL-205ENST00000510451 1013 ntTSL 214.57□□□□□ -0.085e-16■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.785e-16■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 LCORL-204ENST00000510121 486 ntTSL 34.34□□□□□ -1.715e-16■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 LCORL-208ENST00000637787 9431 ntTSL 54.02□□□□□ -1.775e-16■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.995e-16■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 EXOC3L4-203ENST00000559661 665 ntTSL 517.98■□□□□ 0.479e-7■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.625e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 NT5C2-207ENST00000461461 902 ntTSL 518.93■□□□□ 0.625e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.425e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 G2E3-210ENST00000552488 786 ntTSL 312.36□□□□□ -0.435e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.435e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.975e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.295e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 NT5C2-202ENST00000369857 2625 ntTSL 26.95□□□□□ -1.35e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 NT5C2-205ENST00000452156 856 ntTSL 56.78□□□□□ -1.325e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 G2E3-203ENST00000544007 1003 ntTSL 25.02□□□□□ -1.615e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 ZMYND8-210ENST00000446894 341 ntTSL 24.7□□□□□ -1.663e-7■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.745e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 NT5C2-208ENST00000467380 427 ntTSL 34.16□□□□□ -1.745e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 G2E3-209ENST00000550944 565 ntTSL 24.08□□□□□ -1.765e-8■■■■■ 28.1
TARDBPQ13148 HEPH-205ENST00000429547 569 ntTSL 410.7□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 28.1
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