Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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