Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK3Q13003 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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