Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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