Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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