Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 OSM1YJR051W 1506 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 CNE1YAL058W 1509 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 UBC1YDR177W 648 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 SEC20YDR498C 1152 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YHI9YHR029C 885 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 BSC3YLR465C 309 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 RPL13BYMR142C 600 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 NSL1YPL233W 651 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YPR170CYPR170C 336 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 RTC2YBR147W 891 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YPC1YBR183W 951 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 THI73YLR004C 1572 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 RKM3YBR030W 1659 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 CEF1YMR213W 1773 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 MRH4YGL064C 1686 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YCT1YLL055W 1596 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 NHP2YDL208W 471 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 RPA14YDR156W 414 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YER085CYER085C 522 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 ECM4YKR076W 1113 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YNG1YOR064C 660 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YPL067CYPL067C 597 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YPR050CYPR050C 414 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 DIA3YDL024C 1407 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 OSH6YKR003W 1347 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 STR2YJR130C 1920 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YDR417CYDR417C 372 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 FAR7YFR008W 666 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YGR017WYGR017W 894 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 CPD1YGR247W 720 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 OTU2YHL013C 924 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YJR079WYJR079W 330 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 ATP18YML081C-A 180 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YOR379CYOR379C 339 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 HCM1YCR065W 1695 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 MSC3YLR219W 2187 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 KTR5YNL029C 1569 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 RFT1YBL020W 1725 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 CBP1YJL209W 1965 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YHR033WYHR033W 1272 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 DBP8YHR169W 1296 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 POR2YIL114C 846 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 AIM29YKR074W 468 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 PAU17YLL025W 375 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 GLO1YML004C 981 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YOR170WYOR170W 306 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 CET1YPL228W 1650 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 PKP2YGL059W 1476 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 CLB2YPR119W 1476 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 CTA1YDR256C 1548 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 SLA2YNL243W 2907 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 snR85snR85 171 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YER175W-AYER175W-A 165 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 HSP12YFL014W 330 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 SDL1YIL167W 633 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 PRX1YBL064C 786 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 HCH1YNL281W 462 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YNL296WYNL296W 315 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 LSC1YOR142W 990 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 TAE1YBR261C 699 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 NEL1YHR035W 1893 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 VBA1YMR088C 1689 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 ARP9YMR033W 1404 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 QCR10YHR001W-A 234 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 PGU1YJR153W 1086 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 OAR1YKL055C 837 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 MRPL20YKR085C 588 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 UPS2YLR168C 693 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 ASI2YNL159C 870 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 ERV2YPR037C 591 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 SRB6YBR253W 366 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 SDH8YBR269C 417 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 TSR1YDL060W 2367 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 DSS1YMR287C 2910 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YDL109CYDL109C 1944 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YGR035CYGR035C 351 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YGR228WYGR228W 345 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 MAK16YAL025C 921 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 CYC3YAL039C 810 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 MTC2YKL098W 1074 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YNL235CYNL235C 432 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YGK3YOL128C 1128 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 GRX7YBR014C 612 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 FHL1YPR104C 2811 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 ADE12YNL220W 1302 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 CDC7YDL017W 1524 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 SRP1YNL189W 1629 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 RAD51YER095W 1203 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YIP4YGL198W 708 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms