Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 SWR1YDR334W 4545 nt4.29□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 GPI1YGR216C 1830 nt4.29□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 YFL051CYFL051C 483 nt4.29□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 MPS2YGL075C 1164 nt4.29□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 KAR4YCL055W 1008 nt4.29□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 MIT1YEL007W 2001 nt4.28□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 RPL13AYDL082W 600 nt4.28□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 FAP7YDL166C 594 nt4.28□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 FYV5YCL058C 459 nt4.28□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 JJJ1YNL227C 1773 nt4.28□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 TOS8YGL096W 831 nt4.27□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 MPC3YGR243W 441 nt4.27□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt4.27□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt4.27□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt4.27□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt4.27□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt4.27□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt4.27□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 SMA2YML066C 1110 nt4.27□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 NTH1YDR001C 2256 nt4.27□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 ATG18YFR021W 1503 nt4.26□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 KRS1YDR037W 1776 nt4.26□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 LNP1YHR192W 837 nt4.26□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 ASG7YJL170C 630 nt4.26□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 DBP3YGL078C 1572 nt4.26□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 RPP1AYDL081C 321 nt4.25□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 SAM37YMR060C 984 nt4.25□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 CDC16YKL022C 2523 nt4.25□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 PDR1YGL013C 3207 nt4.25□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 SIZ1YDR409W 2715 nt4.25□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 APM4YOL062C 1476 nt4.25□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 ARP8YOR141C 2646 nt4.25□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 PHM6YDR281C 315 nt4.25□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 WSS1YHR134W 810 nt4.25□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 TDA5YLR426W 981 nt4.25□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 EMC1YCL045C 2283 nt4.24□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 ERG28YER044C 447 nt4.24□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt4.24□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 RAD33YML011C 534 nt4.24□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 RAD17YOR368W 1206 nt4.24□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 SSA2YLL024C 1920 nt4.23□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 KIP1YBL063W 3336 nt4.23□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 RAD1YPL022W 3303 nt4.23□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 SDS23YGL056C 1584 nt4.23□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 MCP2YLR253W 1710 nt4.23□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 COM2YER130C 1332 nt4.22□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 FMP41YNL168C 780 nt4.22□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 YGK3YOL128C 1128 nt4.22□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 SCP160YJL080C 3669 nt4.21□□□□□ -1.73
TY1B-BRQ12193 GCR2YNL199C 1605 nt4.21□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YLR374CYLR374C 390 nt4.21□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YOR338WYOR338W 1092 nt4.21□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YEL025CYEL025C 3567 nt4.21□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 CSR2YPR030W 3366 nt4.21□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 LAC1YKL008C 1257 nt4.2□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 TIS11YLR136C 858 nt4.2□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 ABP140YOR239W 1887 nt4.2□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 APL6YGR261C 2430 nt4.2□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YMR085WYMR085W 1299 nt4.19□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YPL039WYPL039W 951 nt4.19□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 CMD1YBR109C 444 nt4.19□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 SRC1YML034W 2505 nt4.19□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 PUG1YER185W 912 nt4.19□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YLL017WYLL017W 312 nt4.19□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 MNN1YER001W 2289 nt4.19□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 GCD1YOR260W 1737 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 ROK1YGL171W 1695 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 SSY1YDR160W 2559 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YLR177WYLR177W 1887 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YCR101CYCR101C 549 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YAL037WYAL037W 804 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 SLP1YOR154W 1764 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 FZO1YBR179C 2568 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 GIN4YDR507C 3429 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 MSE1YOL033W 1611 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 AAD16YFL057C 459 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YOR186WYOR186W 435 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YOR385WYOR385W 873 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 STP2YHR006W 1626 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 VTC3YPL019C 2508 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 STP4YDL048C 1473 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 THP2YHR167W 786 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YKL169CYKL169C 384 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 DGK1YOR311C 873 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 RNT1YMR239C 1416 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YGL140CYGL140C 3660 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 RTT10YPL183C 3042 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 DAL2YIR029W 1032 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 RPL6AYML073C 531 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 VPS36YLR417W 1701 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 MNL1YHR204W 2391 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 HPC2YBR215W 1878 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 SPS22YCL048W 1392 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 TFC4YGR047C 3078 nt4.15□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YJL132WYJL132W 2253 nt4.15□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 AST2YER101C 1293 nt4.15□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YLR036CYLR036C 612 nt4.15□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 YLR255CYLR255C 354 nt4.15□□□□□ -1.74
TY1B-BRQ12193 DDI3YNL335W 678 nt4.15□□□□□ -1.74
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