Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms