Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD47Q08722 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD47Q08722 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD47Q08722 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD47Q08722 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD47Q08722 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD47Q08722 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD47Q08722 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD47Q08722 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD47Q08722 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD47Q08722 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD47Q08722 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD47Q08722 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD47Q08722 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD47Q08722 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD47Q08722 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD47Q08722 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD47Q08722 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD47Q08722 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD47Q08722 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD47Q08722 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD47Q08722 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD47Q08722 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD47Q08722 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD47Q08722 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD47Q08722 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD47Q08722 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD47Q08722 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD47Q08722 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD47Q08722 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD47Q08722 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD47Q08722 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD47Q08722 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD47Q08722 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms