Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TGM3Q08188 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms