Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LRP1Q07954 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms