Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNK2Q07912 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms