Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms