Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHRNDQ07001 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNDQ07001 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms