Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC9Q06265 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms